Et enfin, les organismes vivants eux mêmes, principalement les plantes, modifient constamment l’environnement et les ressources.

En piégeant le gaz carbonique (CO₂) de l'atmosphère primitif pour former des roches carbonatées, ce sont d’abord les algues bleues (Cyanobactéries) ⁽¹⁾ qui ont produit le dioxygène (O₂) et la transformation de l’atmosphère sur des milliards d'années⁽²⁾.

L’oxygène de l’atmosphère a donné par la suite la couche d’ozone (O₃) qui protège les espèces terrestres des rayons solaires nocifs ⁽³⁾, donc a permis aux organismes de quitter les océans.

Puis, l'apparition des plantes terrestres et la photosynthèse végétale ont poursuivi cette production d’oxygène dans l'atmosphère en stockant le carbone organique dans les profondeurs de l'écorce terrestre. ⁽⁴⁾